Er zijn twee soorten polygraaftesten. De oudste, de Control Question Test – CQT (Controle- Vraag-Test – CVT) vooral ontwikkeld door praktijkmensen, is wereldwijd de meest gebruikte (Lykken, 1998: 115; Ford, 1996: 227; Ben-Shakhar en Furedy, 1990: 1). Eind de jaren 50 van vorige eeuw werd de Guilty Knowledge Test – GKT (Schuldige-Kennis-Test – SKT) uitgewerkt, vooral door academici. Al meer dan vier decennia is er in wetenschappelijke tijdschriften tussen academici een discussie aan de gang welke van de twee testen het betrouwbaarst is. Beide partijen zijn niet tegen de toepassing van de polygraaf, hun discussie is academisch.